木本植物成年期所处的阶段，也影响组织或芽对培养基的反应。这样，从幼苗或幼年植物上所得的外植体比从较老植物上取得的外植体更易于分化。幼苗或幼年树木作为外植体时，茎尖和节段也会比较容易形成不定芽或根。这种不同的反应是由于幼年和成年植物不同的生理反应而引起的。这一生理现象不利于森林树种的繁殖，因为在木本植物中选择的优良性状，只有当树木经过幼年生长阶段到成年，并生长良好时才能显示出来，而当树木进入到成年后，在这些个体中采集外体进行组培繁殖就比较困难了。
为了克服这种问题，较老组织的成熟状况可以通过剧烈的修剪和不断地将成年植株幼枝的芽嫁接到幼苗的根茎而逆转。再次长出的芽比较年幼，可以作为愈伤组织培养或茎尖或节段的外植体。从成年组织上获得的腋生芽的不断转接也会提高腋生苗的根能力。
另一种方法是为这些成年个体复杂的多基因性状建立分子标记，例如抗疾病和抗虫害、高度、木材质量、生长率以及对环境胁迫的抗性等性状。尔后，可以在年幼的子代个体中监测这些标记，携带有特定性状标记的幼年植株可以通过标准的微繁技术很容易地繁殖起来。分标记利用由限制片断多态性（RFLP），随机扩增片断多态性（RAPD）和卫星分析得到的与特定性状相关的染色体带型。如果选择在苗期或幼年期，而不是在成年期进行优良单株的选择，可以节省许多年的时间。
由培养细胞再生完整的植株有两种不同的方式：或是通过茎芽的分化，是通过体细胞胚胎的发生。根据可见的形态差异可把茎芽与体细胞胚区别开来。前者是一种单极性结构，里面长出原形成层束，与原先存在与愈伤组织或外植体中的维管组织连接在一起。与此相反，体细胞胚是一个双极性结构，胚根的顶端是封闭的。此外，一般认为，体细胞胚是由单细胞源的，并且与母体愈伤组织或外植体无维管束相连。但对这种见解近来已有人提出异议，认为体细胞胚也可能起源于一个以上的细胞。