高温闷棚是夏季蔬菜棚室消毒灭菌的常用措施，闷棚结束后要注意以下三方面的管理。

一是高温闷棚后要及时补充生物菌肥。经过高温作用，不管是有害菌还是有益菌，都被大量杀灭，土壤处于“空白”阶段。多菜农觉得高温闷棚效果不好，病害甚至比闷棚前还严重，其原因就在于没有及时补充有益菌，一旦病原菌先行传入，缺少了有益菌的抑制，病原菌会更快更猛烈的繁殖起来，导致闷棚后病害发生更重。生物菌肥在蔬菜定植前均匀施入定植穴中，以保护根际环境，增强植株的抗病能力。

二是揭膜后不要立即定植蔬菜。因为土壤中拌有农家肥等有机肥，在高温发酵的过程中产生大量的氨气，所以应当在揭膜通风5～7后天再定植蔬菜，以防产生气害。

三是闷棚后小心病虫害再传入。经过一段时间的高温闷棚后，棚内的病原菌基本已被杀死。棚内病原菌少了，不代表蔬菜就不会得病了，种苗、农具、鞋子等都可能会将病原菌重新带入棚内。

高温闷棚时，要把经常使用的菜筐、水带、锄、铁锹、旋耕机等常用工具和进出大棚的工作服、工作鞋等一块放入棚内闷一闷。在大棚中干活的衣服和鞋子最好是专用的，出棚要换下来；育苗要采取无土基质，育苗土必须进行消毒，杜绝或减少外来病菌和线虫的再次侵入。