从化学的角度上进行划分，肥料可以分为有机肥料和无机肥料两种类型。能够作为花卉的肥料不下百种。有些认为，所养的试管苗长不好就是由于没找到合适的肥料。实际上，花卉本身对于肥料的需求并没专一性，也就是说，没有哪一花卉必须使用某种肥料才能长好。下述种类均为适合花卉试管苗使用的肥料：
①有机肥料：有机肥料即通常所说的农家肥料。其特点是无固定的组成，大多不易溶于水，肥效较为久，通常用量较多才能见效。有机肥料对土壤的改良性较强，其主要包括鸡粪、麻渣、马蹄片、鱼内脏等。其中较常使用者的主要特点如下：
鸡粪：作为一种全素肥料，其不仅能够提供花卉生长所必须的多种矿质元素，而且还能对盆土的物理性质起到调节作用，从而有利于植株的长发育。需要注意的是，鸡粪的肥力较强，用量不宜过大，否则容易烧苗。在使用前可将收集到的鸡粪晒干后捣成小块置于塑料袋中放在干燥、凉爽的地方进行保存。
麻渣：在使用麻渣作为追肥时，需要注意的是用量不宜过多。此外，不应避免将其与花卉的茎杆直接接触，否则会烧伤”茎部，导致肥害发生。由于麻渣在遇到少量水后会释放出很多热量，同量放出氨气，因此高温季节应该在傍晚时施用，而低温季节在上午时施用。
②无机肥料：无机肥料即通常所说的化学肥料。其特点是有固定的组成，多为化合物，大多易溶于水，肥效十分迅速，通常施用少即可见效。无机肥料对土壤的改良性较差，其主要包括过磷酸钙、磷矿粉、磷酸二氢钾、磷酸氢二铵、氯化铵、碳酸氢铵、硝酸铵等。其中较长使用者的主要特点如下：
过磷酸钙：其纯品为白色粉末，常聚结成块状，微溶于水，呈较强的酸性反应。它是磷矿粉与硫酸共同反应所成的一种化肥，其主要成分为磷酸氢钙。过磷酸钙是一种缓效的磷肥，通常作为基肥使用。
磷酸二氢钾：其纯品为无色结晶，易溶于水，呈微酸性反应，是速效磷、钾复合肥。主要作为浸种肥、催花肥使用。通常采用根部浇灌，或叶面喷施的方法加以施用。当将磷酸二氢钾溶解于中后，有时所获溶液常常会出现白色沉淀，这是由于水中含有钙镁离了的原因。在水质呈微碱性反应时，溶液中就会出现磷酸钙、磷酸镁的结晶，这种现象如不是很严重，一般不会对磷酸二氢钾的使用造成明显的影响。可将其贮存在玻璃瓶中，放置在干燥、凉爽的地方进行保存。
酸氢二铵：其纯品为无色结晶，易溶于水，呈微碱性反应，是速效氮、磷复合肥。主要作为追肥使用。通常采用根部浇灌，或叶面喷施的方法加以施用。磷酸氢二铵不宜在碱性较强的土壤中施用，否则其中所含的铵容易气化，而造成损失。可将其贮存在棕色玻璃瓶中，放置在干燥、凉爽的方进行保存。
氯化铵：其纯品为无色结晶，易溶于水，呈中性反应，是速效氮肥。主要作为催叶肥使用，通常采用根部浇灌，或叶面喷施的方法加以施用。氯化铵作为观叶类植物的追肥效果很好，但是它不适于作为葡萄的追肥，因为葡萄属于忌氯作物。可将其贮存于玻璃瓶中，放在干燥、凉爽的地方进行保存。
③施肥时间：从某种意义上来说，何时为花卉试管苗施肥料比施用什么肥料更为重要，在它们的生长过程中，并不是任何时期都需要大量肥料。一般来说，当其发育到某一阶段时，如果缺少养分，以后无论再施用多少肥料都无法弥补当时缺肥对其所成的伤害，这个对肥料特别敏感的时期被称为需肥临界期。因植物的不同它们的需肥临界期也不同，但是对于大多数花卉而言，其需肥临界期主要在幼苗期等阶段。
④肥料用量：施肥数量的多寡严格地说是应该根据经过土壤分析、植株生长分析，最终才能予以确定，但是作为花卉管苗来说却无需这样严格。通常应掌握的原则是大株多施，小苗少施；病株少施，壮苗多施的原则。一般来说，在体积相同的情况下，无机肥料的有效成分相对来说较高，而有机肥料的成分相对来说较低，因此在施用农家肥料时，其数量要多一些。
⑤施肥方法：从施肥的方式来看通常分为施用基肥和施用追肥两种类型。常用的基肥有鸡粪、麻渣、过磷酸钙、磷矿粉等，基肥的作用在于能够持续稳定地提供给植株所需要的养分，可以先将肥料溶解在水中，再采用叶面喷施等方式来给试管苗提供营养。研究表明，在叶片上有很多气孔，此外还分布着外连丝，通过它们料便能进入植物体内，以满足其生长发育之需要。在进行叶面施肥时，所使用的肥料均要易溶于水、对叶片伤害较小，常用者有硝酸铵、磷酸二氢钾等。