除取材部位外，取材季节也是重要影响因素之一。例如，马铃薯在4月和12月取的茎叶外植体有较高的块茎发生能力，而在2-3月或5-11月取的外植体，则很少有块茎发生能力。对大多数植物而言，应在其生长开始的季节采样，若在生长末期或已进入休眠期时取样，则外植体可能对诱导反应迟钝或无反应，如番木瓜茎尖在冬季取材进行培养，则较难成活。2-4月，11月－次年1月取材培养，其成活率也很低。在母株生长旺盛的季节取材料，不仅成活率高而且增殖率也大。如苹果芽在3-6月取材的成活率为60％；7-11月下降到10％，12月－次年2月都在10％以下。
