一个植株可直接从一个胚发育出来，而通过茎芽的再生却需要另外一些步骤。从茎芽那里发育出的嫩枝能再生不定根或者在分离并转移到无植物激素或仅含一种生长素（NAA，特别合适）的缗嘌基以后就能够生长出根来。也可能在同一培养中，发生相邻的茎芽和根原基，以后借助于分化的输导组织联合成为一个具有功能的活体。
试验结果表，从培养外植体所得到的芽体通常是没有根的，要把芽体剪下后转移到生根培养基上使其发展，这样才是一棵完整的植株。所谓根培养基，主要是培养基中生长素含量较分化培养基中的高，或者不用细胞分裂素。常用的生长素有吲哚乙酸（IAA）、吲哚丁酸（IBA）和萘乙酸（NAA）等。要经过摸索，找出适当的生长素种类和浓度，生长素浓度过高，容易使茎基部形成一块愈伤组织，而后再从愈伤组织上长出根，这样，因为茎与根之间的维管束连接不好，影响养分和水分的输导，移栽后不易成活。生长素浓度过低，则芽体不能发根。或者，将剪下的芽体浸泡在含有一定浓度的生长素无菌溶液中，几个小时后再接种到无激素的培养基上，一般1周左右可分化出根原基，2~3周后即可移栽。也就是说植株在栽前必须经过适当老化，使植株能自养发育和适应温度、光强的变化，也具有一定程度的抗微生物感染的能力。另外，像鳞茎、球茎、块茎和其他类似的贮藏器官，应满足他们的休眠要求。