该项目针对我国芒果、菠萝、剑麻、咖啡等12种特色热带作物开展了种质资源收集评价和创新利用，取得了重大突破与创新。在种质收集方面，提出了特色热带作物种质资源保护利用新思路，构建了资源安全保存技术体系，收集保存资源5302份，占我国特色热带作物资源总量的92%。在种质评价方面，在全国首次创建了特色热带作物种质资源鉴定评价技术体系，鉴定准确率达99%；对资源进行系统鉴定评价，并提供资源信息共享22.6万人次、实物共享6.3万份次，筛选优异种质107份，为产业培育发挥了关键性作用。在种质创新利用方面，创制新种质89份，培育桂热芒120号、红铃番木瓜等系列新品种34个，卮捶木瓜、剑麻等组培快繁技术，构建了与优良新品种相配套的种苗生产和栽培技术体系，并在海南、广东、广西等5省区广泛应用，累计推广1850万亩，特色热带作物良种覆盖率达90%，社会经济效益926亿元，新增社会经济效益555亿元。

我国热区包括海南、广东、广西、云南、四川等8省区，面积50万平方公里，是热带作物的主要产区，资源十分稀缺，发展热带作物对保障我国热带作物产品的有效供给、促进农民增收具有重要意义。